Принят Решением Представительного Собрания Шекснинского муниципального округа от 30.09.2025 г. № 17 "Об утверждении Положений о гербе и флаге Шекснинского муниципального округа Вологодской области"
Зеленый цвет символизирует природные ресурсы округа, основную территорию которого занимают леса. Они имеют не только природно-экологическое, но и промышленное значение.
Лазоревый столб символизирует водные ресурсы, как природные, так и созданные искусственным путем (Волго-Балтийский канал, Шекснинское водохранилище), играющие важную роль в жизнедеятельности округа – Шекснинская ГЭС.
Серебряная ладья, входящая в зеленый створ шлюза, символизирует историческое значение и развитие водного пути, ставшего большой транспортной магистралью, которая имеет большое значение для экономики округа.
Вольная часть символизирует принадлежность округа к Вологодской области.